以電子密度差異來觀察鍵

講座六

講座六:以電子密度差異來觀察鍵

    Michael McBride教授:所以,我們希望瞭解繞射圖形。很明顯的,造成散射的電子排列,和所得到的散射圖形間有一些關聯性,對嗎?在特定的角度,會有特別強的散射,它必定與電子排列情形有關。我們感興趣的是,其如何相關?我們要做的是,稍微看一下-在真實例子中,沒有人瞭解這個;人們撰寫複雜的電腦程式來試圖瞭解,讓它看起來不是那麼神秘。我希望你們明白它運作的原理,Okay?我們顯示的第一張幻燈片,或事實上是上次我們顯示的第三張幻燈片,是一堆我們稱之為苯的分子-即6個點的集合,它們都有相同配向。這不是很合理,除非它們是在晶體中規則排列,這就是我們將要討論的。總之,如果有一堆這些分子,它們是隨機分佈的,其結果為產生更強的散射,與造成散射的分子數成正比,對嗎?但所得到的圖形模式與單一分子相同,這就是為什麼我們使用這個有趣的幻燈片。 這是其所產生的圖形,這圖形有點像雪花。我希望你們能瞭解,為什麼這些點形成的六邊形,會產生雪花圖形。因此,藉由這些點所形成的六邊形,我們要尋找些什麼,來得知散射可能出現在何處?來得知-是什麼?記得所用的技巧是什麼嗎?技巧就是,觀察位於等距平面的分子,試著選擇一組平面,使之有盡可能多的電子,位在這組等距平面上,或其附近。這是二維模式,所以我們要找尋線或是平面的截面,對不對?我們要怎麼在這裡畫線,等距的線,使所有點都位於其上?我們可以畫成這樣,對不對?因此,它們距離相同,有三組,所有電子都落在其上,或在其附近。請注意,它們不需確實落於其上,因為如果它們稍有些位移,與其他相較之下,波的相位將會有點改變;但只是一點點。因此,它只需接近,不需完全位於其上。Okay,所以我們找到了。因此,這意味著,會在這個方向得到散射,它們將彼此增強。 讓我們回顧一下之前所做的實驗演示,在這裡,Okay?我們在課程開始時,討論過這個-一個波進入,使所有粒子在同一時刻上下移動,就是這裡和這裡的電子。事實上,是讓三個電子均震動,以產生波,Okay?我們感興趣的是,光從什麼角度散射出來,這些電子共同散射彼此增強。我們到這個位置,看那條垂直線,我們看到,在那個角度上它們並非全都同相;不過,當角度增加,到達這個位置時,看起來並不太糟。頂端和底部的確實同相,但中間那個是異相,它抵消了頂端那個。如果有一整排電子,第二個將抵消第一個,第四個將抵消第三個,第六個將抵消第五個,以此類推;不會產生任何散射光。現在,我們向外延伸一些角度,這裡值得強調一下;假設這是一條非常長的散射物體,對嗎?最前面兩個-我們看這個位置,在此處它們均為同相,這顯然是一個有非常強散射的角度。假設我們來看另一個與它很接近的角度,與其只有極小差異,最前面兩個的同相散射只差1度,與下一個同相散射只差2度,差不了多少,okay?那麼,我們仍然可由它得到相當強的散射光嗎?Russell? 學生:如果它是很長的一串,你最後會得到一個- Michael McBride教授:如果它是一個非常長的一串,如果第1個差1度,到第180個時,就會差180度,或精確的說-因此第180個將抵消第1個,第181個將抵消第2個,第182個將抵消第3個,以此類推;對嗎?因此,它必須-如果有相當長的一串粒子,它從一個到下一個的位置必須是準確的,相互作用以得到散射。你得到的散射光將相當強,因為它是來自於整堆粒子的共同散射,對嗎?在上周的講座中,你們看到它到哪去了?在週五的講座中? 學生:形成了點。 Michael McBride教授:對,當有一列相當長的粒子時,你們看到它形成非常細小的點。Okay,回到這裡來。因此,會有幾乎完全同相的情形,也存在著某個特定角度使它們同相。箭頭的尾端顯示了那個角度,因此,在那裡形成了一個點。同樣的,因為其對稱性,6個點中的其他5個點也如此,你可以用同樣方式畫出其他角度,大家都同意我所說的嗎?Okay,現在我們要找出,在等距平面上,或其附近的電子密度;因為它僅需在附近。還有其他方向是我們可以畫出的,所以我們得到了一組平面。在那裡,它們接近那些平面,但並非位於其上;像是這裡,對嗎?現在,一個是在此平面上面一點,兩個是在下面一點,對嗎?對第二條線來說也是,對嗎?但它們相當接近,且相距某特定距離,這個間距比藍線的間距大,大家都有看到嗎?這意味著在何種角度上,反射,或說是散射會發生?它們將在何處同相? 學生:較小的角度。 Michael McBride教授:較小的角度。因此,這是它產生雪花圖形的部份,對不對?較小的角度,因為它有較大的距離,你們馬上就可以瞭解為什麼會這樣。我們看看這個,如果你由頂端審視到底部,它們相距很遠,線之間相距很遠,你在這裡得到第一個反射。但如果線彼此更接近,像這兩條一樣,必須到一個更高的角度,才能得到第一個,第一個同相散射,對嗎?所以這是倒數關係,Okay。我們得到像這樣六個一組的點,這是大部分的圖形模式,但在其他地方你也可以看到它。例如,你可以畫出這些線,在這組線中,每個-每個點的中心均在一直線上,中間恰好有一條線,其上沒有任何粒子;但誰在乎呢?對嗎?其他粒子是在等距的線上,對嗎?因此,它們均為同相。這個反射會到哪裡?接近還是遠離? 學生:遠離。 Michael McBride教授:遠離。你們可以看到,它向外射出到那個邊上,你們看得到它嗎?只看到一點-我可以關掉教室的燈,但我不認為有必要。你可以看到它在這裡,因此,外面那裡也有6個點,Okay?你藉由找出等距平面,瞭解這個運作原理,對特定電子的排列而言,你可以預測圖形模式會是如何。注意這些遠處的散射非常弱,因為雖然點的中心是在一直線上,但這些線的距離太接近,有部份電子密度並非正好在線上,事實上,它幾乎是在這些線的中間位置,對嗎?那部份的電子密度將被抵消,因此,當線彼此越來越接近時,大部分的電子密度在這裡是同相的,但有些卻是異相的。事實上,電子的分佈是限制在某個區域,而不是微小的點。也就是說,當角度越大時,散射會越變越弱。Okay,所以我們再次注意到,平面的距離越接近,會形成越大的角度,這是我們剛剛所討論的。 當使用這些苯的規則晶格幻燈片時,記住,如果只有單一分子,會得到這個雪花圖形;如果是一整列分子,橫越頂端,像這樣-啊,抱歉,我的意思是說,這個會是非常弱,你將很難看到它。你需要的是一群粒子共同作用,才能夠使你看到這些。現在,首先,我們用頂端整列的分子,只看垂直方向的散射。我在圖片上將它們的範圍縮小,但是,如果我們用頂端這一整列分子,記住,對上下方向的散射來說,它們均在鏡射角產生同相散射。現在散射變強,因為所有分子共同作用。在其他方向,從一個六邊形到下一個,它們不會全都同相,但上下方向的散射都在同一層上,它們會完全同相。 Okay,假設我加上下一列分子,它們在相同方向的上下散射是否同相?就是第一列分子均同相的方向?此處顯示的是它散射的情形,對嗎?比之前的散射強,因為現在是一群分子的作用,對嗎?但還不是相當強;讓我們再加入下一列。這是否會令它們全都變得更強?不會,大部份時間它們是異相的,就是下一列分子在這個方向的散射,對嗎?大部份時間它們是異相的,但在某特定角度,它們將同相。所以,實際情形將是,如果我們加上下一列分子,圖片變得較亮,因為現在有兩倍的分子產生散射,但會有柵欄圖形橫越其上;像這樣,它總是相同的圖形模式,越變越亮。當我們添加更多列,在某些角度它們是同相;而在某些角度它們是異相,從一種圖形到下一種,或從一列到下一列。如果我們將整張的分子都加上,會發生什麼情形?你們看得出來嗎?Sam? 學生:會得到非常細的- Michael McBride教授:啊,只有在相當精確的角度上,它們皆產生干涉。另外,像是第180列與第1列分子產生干涉,第181列與第2列分子產生干涉,以此類推,對嗎?因此,如果我們加上所有的相,所有的分子;如果我們看這個圖形,它會變得較亮,對不對?但只有在非常精確的角度上,它們成點狀,對嗎?這正是我們會看到的,就是這最後一張圖片,來自晶格的散射。這意味著,在規則的分子模式中,晶格重覆聚集了雪花狀的散射,形成緊密集中的點,對嗎?這是苯的二維晶格繞射圖,這與來自一個分子的雪花基本圖形模式相同,但它看起來像是如我上次說過的,透過釘板所觀察到的,對嗎?所有的散射集中到幾個點上,非常亮,就是這些規則的小點。有些同學似乎不知道釘板是什麼,所以我週末時照了釘板的相片。有多少人之前從未見過釘板,告訴我一下?Okay,大多數人都看過釘板,你可以掛上這些掛鈎,然後就可以掛上想掛的東西,像是工具、或圖片、或任何你想要掛在牆上的東西,Okay?這就像是透過這些洞來看,就是這些雪花圖形。 現在,有兩個引號,中間寫著直空間或真實空間;繞射空間或倒數空間,Okay?因此,晶體是你真正感興趣的東西。在繞射空間的是繞射圖片,你看到這些勞厄所看到的點,例如硫酸銅,對嗎?因此,在真實空間會有單位晶胞結構,就是這些圖形模式,重覆形成晶體,但你可以得到這個圖形模式,對嗎?它會產生這個模糊的圖形,就像在倒數空間中的雪花一樣。然後你會得到一個晶格,就是這些圖形的規則重覆,對嗎?像是透過釘板上的洞所觀察到的圖形,Okay?記住,在真實空間中,間距的減少,對應於倒數空間中間距的增加,這當然就是為什麼它被稱之為「倒數」,Okay?關於它如何運作,正是我們想要瞭解的,對嗎?有一些圖形產生倒數空間中的圖形,就是那個模糊的影像;如果它有重覆晶格,就會集中到特定的點上,但有相同的基本圖形模式。因此,這個圖形就是分子的結構;這個晶格就是晶體的結構。 Okay,現在讓我們看看燈泡的燈絲,這是我們最後要看的,瞭解為何來自於它的散射,看起來-看起來像這個旁邊有點的 X 圖形,Okay?我們把-我們想知道,是否有電子在這個螺旋上,對嗎?我們可以找到一組等距且平行的平面,就像這裡的黃色線。因此,我們將得到垂直於這些平面的散射,確實有,就是那個點。但也可以找到另一組平面,不僅是向上,也向下延伸,形成兩個支臂,形成X某一特定支臂的兩個方向,來自於相同的平面,Okay?但你可以使這些平面彼此接近兩倍,對嗎?那會導致什麼情形? 學生:延伸到更遠處。 Michael McBride教授:延伸到兩倍遠處。事實上,這個符號變成兩倍大,而不是實際間距;就是那個,第二個順著臂延伸出去,Okay?現在,那將會變成-你預期這會比較亮,還是不像第一個那麼亮? 學生:不那麼亮。 Michael McBride教授:不那麼-它可能不像第一個那麼亮,原因是-有兩點原因,與亮度有關。一個是平面上的電子密度,相較於平面間電子的密度,對嗎?我們看這裡-以原先的黃色平面來看,有很多,幾乎所有電子都在這個平面上;平面間並沒有很多,只有這線圈(燈絲)的一層薄截面,Okay?當平面越來越接近,事實上線圈是厚度是有限的,意味著線圈某些部分,線圈的相同部分,與其餘部份相較之下是異相。由於它的有限厚度,可以預期當其向外延伸時,強度逐漸下降,你會得到第三條沿著支臂的散射等等。你也可以在另一個方向,使用同樣的技巧,對嗎?這就是為什麼它是一個X圖形。你可以畫出類似的鏡像線,Okay?那麼,X的角度能給你什麼資訊?X可以看起來像這樣,或像這樣,對不對?你從X所形成的角度能知道些什麼? 學生:螺旋纏繞得有多密集。 Michael McBride教授:螺旋纏繞得有多密集。因為如果螺旋很密集,平面將會像這樣。如果你抓住彈簧並將它伸展,它們會像這樣,對嗎?因此,X的角度表示螺旋纏繞的密集度,代表螺旋的螺距,Okay?由點的間距,你能得知什麼?你們做了我建議今天該做,但不必繳交的作業嗎?這樣你就會知道,點的間距代表什麼意義。如果你知道X光的波長,或在這個範例中的光波長,點的間距能告訴你什麼? 學生:平面間距。 Michael McBride教授:它告訴你實際上連續螺旋間,及平面間的距離為何,因此,它告訴你螺旋的大小,對嗎?由X得到的角度,但實際螺旋有多大?你從這些點的間距可以得知。如果知道在這個範例中的波長和距離,擴大來看由教室後面幻燈片到前面的距離,就可以得出答案。而點逐漸變弱,是因為線圈的厚度。正如剛才所解釋的,當繼續向外延伸時,這看起來非常像羅莎琳•佛蘭克林1952年所攝的B-DNA照片。因此,我們看到了螺旋,還有它以何種角度連續彎曲,螺旋的螺距大小為何,從點的間距,可以得知實際螺旋有多大。 但還有些有趣的地方。當向外延伸時,強度不是均勻減少,並不是變強、不那麼強、較不強、較弱、很弱;當向外延伸時,它變弱、變強、變強、非常弱、變強,為什麼會這樣?為什麼會有這樣一個有趣的強度模式?讓我們再次來看看這個。記得在那兒,如果我們看第一個,第二個,和第三個等等,可以看到它們同相及異相,但我們假設-它會是,如果物體彼此接近兩倍,在第一種情況下,它對我們所看到的實際圖形會造成什麼影響?我們所看到的圖形,如果我們只看間隔這些,這個直射波束,第一個反射,第二個反射,第三個反射,第四個反射,如果中間再加上一個波,會有何不同?Okay,如果看所有的三個波,這是第一個反射-看得到嗎?如果沒有中間那個的話,會產生第一個反射。如果有一整排的波,我們會在這裡看到反射嗎?不,因為它們彼此抵消了;因此,我們不會看到這個反射,下一個呢? 學生:它會是非常明亮的。 Michael McBride教授:是的,它會是非常明亮的,因為產生散射物體比較多。如果進行到下一個會如何?沒有,什麼都沒有;它們彼此抵消了,對不對?下一個呢?你察覺到所產生的圖形嗎?是什麼?什麼? 學生:它是連續的,你看到它,然後又看不到了。 Michael McBride教授:你可以用數學的方式來描述嗎?假設我們將它們編號,直線前進的那個,我們編號為0,然後是第1個,1、2、3、4、5,如果中間加上一個,會發生什麼情形? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:這裡有一個反射嗎?這裡有一個反射,對不對?對頂端的和底部的波來說,這裡有一個反射。這裡有嗎? 學生:沒有。 Michael McBride教授:第2個如何? 學生:有。 Michael McBride教授:第3個如何? 學生:沒有。 Michael McBride教授:沒有,第4個如何? 學生:有。 Michael McBride教授:什麼-你們可以用數學的方式來描述嗎? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:Lexie,你怎麼描述它? 學生:(無聲) Michael McBride教授:我聽不太清楚。 學生:n+2? Michael McBride教授:哪些消失了? 學生:奇數的。 學生:偶數的。 Michael McBride教授:奇數的,1,3,5,7,9;如果我們額外放一個在中間的話,奇數的消失了,但偶數的仍然存在。現在讓我們考慮DNA的情形。這裡有一個螺旋,對不對?但是,你會如何描述DNA?它只有一個螺旋嗎? 學生:它有雙螺旋。 Michael McBride教授:它是一個雙螺旋結構,因此有兩個螺旋,Okay?假設我們有-它有連續彎曲,我們在特定角度得到散射,假設我們用雙螺旋來看,會發生什麼情形?Lexie,你再幫我一次。 學生:哦! Michael McBride教授:如果我們將第二個螺旋纏繞在第一個螺旋中間,會有何不同?會發生什麼?從一個螺旋可以得到1、2、3、4、5、6、7、8、9個角度,對嗎?現在會發生什麼情形? 學生:偶數的消失了。 Michael McBride教授:我聽不到。 學生:偶數的消失了。 Michael McBride教授:啊!所有奇數的都消失了,對嗎?那麼,你預期在羅莎琳•佛蘭克林的圖片中看到什麼?對嗎?它將會是弱,強,弱,強,弱,強,對嗎?但總體來說,當向外延伸時,會越來越弱,因為線圈的厚度是有限的。我們看到的是這樣嗎?不,我們看到-第一個非常弱,然後是強,強,非常弱,強,你能看到任何-怎麼會這樣呢?這告訴你一些什麼?請說? 學生:它們不完全同相。 Michael McBride教授:你說它們不是完全同相是什麼意思? 學生:它們不是相等的- Michael McBride教授:啊!也許第二個不是剛好在第一個彎曲處的中間,對嗎?會發生什麼情形?因此,當平面彼此接近兩倍,它會抵消每隔一個的反射,即所有奇數的反射。但是,假設它是像這樣的-你們之前有沒有看過像這樣的情況?就是重覆的部份不是一條線,而是一對的線?Angela? 學生:第二種繞射- Michael McBride教授:我們所看過的第二種繞射圖形,就是這種情形。它顯示了相同的點,但其強度是有變化的,還記得嗎?Okay,我們不考慮相同間距的情形,讓我們來看不同間距的情形。像這樣,現在-哎呀!這裡鬆了,我們開始。哦,不,我們開始,okay?現在考慮頂端和底部的,它們是有相同連續彎曲的螺旋,將中間的移開,我們僅考慮頂端和底部的,Okay?這是第一個反射,第二個反射,第三個反射,第四個反射,大家都有看到嗎?請告訴我,在頂端和底部的之間,如果我另外加上這個剛剛移開的,會發生什麼情形?第一個反射會如何,它會是強的嗎? 學生:不。 Michael McBride教授:不,因為這個將它抵消了。請記住,還有一個像這樣的波在這個下面;記住,這是很長一列物體,因此,它幾乎完全抵消了;不是完全,因為它不是完全-確實會有最小值,而當第一個和第三個同相,第二個不完全是異相,但相當接近異相時,反射將會非常弱。現在我們來看單股螺旋的第二個反射情形。這裡會如何? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:是的,第二個現在貢獻了一點點反射;並不完全,但它-事實上,如果我們再向外一點點,可能會更好。但無論如何,這裡會有反射,Okay?來看第三個反射,會有什麼情形?和第二個一樣,對不對?來看第四個反射,會有什麼情形?第四個會-如果它們間距相同,你預期第四個會如何? 學生:非常強。 Michael McBride教授:非常強,對不對?讓我們到第四個的位置,一、二、三、四,它應該是什麼情形? 學生:相當弱。 Michael McBride教授:相當弱。第五個如何? 學生:強。 學生:相當強。 Michael McBride教授:這正是她所看到的,對嗎?弱、強、強、非常弱、強。所以,這是多少-由它偏移中央多少距離,可得到這個散射強度序列,大家都同意我說的嗎?Okay,這是我們之前看過,重覆的一對圖形。你看到這個DNA的外部纏繞,其中含有磷酸,它有許多電子,非常像這個螺旋,Okay?接近這些平面的電子密度,比平面之間-比它中間多得多;但在藍色平面上、藍色平面附近的電子密度,比在其之間多得多。出於同樣的原因,這意味著,你可以在這附近得到這些點,這讓你得知了螺旋的直徑,Okay?這頂端和底部的東西,讓你得知堿基堆疊的距離。我倒回來一下,讓你們看看我指的是什麼,對嗎?這裡有一群電子,這裡有一群電子,還有這裡,這裡也一群,它們造成了這個方向的散射。因此,所有這些資訊-螺旋的直徑,事實上,它是一個螺旋,一個雙螺旋;事實上,它是一個偏移的雙螺旋,還有圓柱直徑。如果你知道你要尋找的是什麼,這些都是很容易看出來的。柯立克知道,因為他一直在研究蛋白質的螺旋,所以他知道-他由螺旋的散射得知,Okay?知道了分子的電子密度,還有我們的人造苯模型,或這個DNA,就很容易計算出這個晶體的繞射圖形,特別是如果有電腦的幫助。但這不是個智力挑戰,只是尋常功課而已,對嗎?使用相當大型的數學運算或定型程式,因為發展這個,人們得到了諾貝爾獎(這就是他們得到諾貝爾獎的原因)。你可以由另一條途徑-從X光繞射圖形,進行到是什麼產生了它,對嗎?我們所做的就是,從是什麼產生這個圖形起進行;但事實上,現在你可以由另一條途徑。當你按下機器上的按鈕,你會得到空間中每一點的電子密度,Okay?那是由X射線結構所得知的。為什麼你不會得到原子核的位置,而是得到電子的位置? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:Alex?我聽不見。 學生:它太大而無法產生繞射。 Michael McBride教授:是的,它太重了,因此原子核不會振動,不會有像是天線的功能,像電子那樣釋放出新的波,Okay?因此你得到一個結果,可以繪製在圖上。昔日,當我開始做這個時,所得到的圖是一大張電腦輸出紙,上面有數字;還有一張特殊的紙,就是通過「單位晶胞」,通過這個圖形的特殊切面。列印出的數字,說明了在這個平面上特定點的電子密度;所以,有x軸、Y軸,在這一點上的是75、42、55、87,或不管是什麼數字,你要做的,就是拿一枝氈頭筆,連接同樣大小的點,就會得到特定電子密度的等高線。這是某特定化合物的圖形,來自當時一本由Stout 及 Jensen所寫的書。你用手工繪製這些,因為沒有電腦幫忙畫-它可以計算出該畫在哪裡等等。當有一個在特定晶體結構中的原子,然後,不同切面產生了一大堆紙張,穿過這些電子密度,將它們堆疊起來,對嗎?有時,你操作的某特定切面,從原子正中央穿過,所以有非常高的電子密度;有時,它僅僅是接觸到原子,對嗎?所以你看到的這個原子,這個特定的切面,非常接近原子核,所以有高的電子密度;但是這個,原子核不在此平面上,因此只是稍微接觸到它,Okay?但是你可以將其繪製在醋酸膠片(透明繪圖膠片)或膠片上,並將它們堆疊,對不對?這是第一個被確定的模型,就是盤尼西林的結構。事實上,是盤尼西林的鉀鹽結構。鉀原子在哪裡?你如何區分鉀和氮,或是碳、或氫、或氧? 學生:電子密度。 Michael McBride教授:它有較大的電子密度,看到了嗎?這是鉀,電子密度比較大,Okay?這裡有一個分子,這正好是平面的,因此,切片有可能通過幾乎所有的原子核。這不是一個很常見的分子類型,但這個是Rubofusarin,Okay?現在這些等高線繪製的間隔,是每立方埃一個電子,對嗎?因此,第一個是每立方埃1個電子,每立方埃2個電子,每立方埃3個電子,以此類推。現在有碳和氧兩種原子在此,你如何區分出哪個是氧? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:請說,Yoounjoou? 學生:它較具陰電性,所以它們應該有更多的等高線。 Michael McBride教授:它們應該有更多的等高線。因此,如果看這裡,我們看到這個,是每立方埃5個電子,一、二、三、四、五個環,對不對?那個是每立方埃7個電子,這些也相同,對嗎?因此,這些是氧,Okay?這裡有一張結構圖,你可以看到,這些確實是氧原子。我們看這些東西的基本目標是什麼?我們希望看到什麼? 學生:鍵。 Michael McBride教授:鍵。你們有看到鍵嗎?這看起來像什麼?這看起來只是一堆球,那裡只有原子。路以士是對的嗎?鍵結的原子間是否有電子對?不,就只有原子而已。Okay,為什麼沒有氫? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:因為與其他原子比較的話,它們幾乎沒有任何電子,對不對?因此它產生的效應非常弱。Okay,這些是鍵,你可以看到它們在那裡。這些線是從哪裡來的? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:Angela,你說什麼? 學生:有人畫出了這些線。 Michael McBride教授:是的,是人們畫出的。你怎麼知道要在哪裡畫出這些鍵? 學生:連接這些點。 Michael McBride教授:你連接這些環的中心,對不對?這些就是鍵。你怎麼知道什麼是單鍵,什麼是雙鍵,什麼是三鍵? 學生:密度比較大? Michael McBride教授:注意這個結構,在右下方的有雙鍵和單鍵。我要怎麼知道哪個是什麼鍵?有什麼方法可以知道?Elizabeth? 學生:也許是它們之間的距離- Michael McBride教授:啊,距離!雙鍵應該比單鍵短。事實上,注意,我們會有短的、長的和中間長度。為什麼有中間長度? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:為什麼我在這裡畫了虛線呢? 學生:(無聲) Michael McBride教授:因為這個,看這裡,共振,對不對?因此,有一個半的鍵,對嗎?Okay,基本上,我們看到的是球形原子,對嗎?看不到鍵,看不到氧上的未共用電子對,只看得到原子。所以,路以士大錯特錯嗎?其實你可以用 X 射線看到鍵,但你要看的不是我們這裡看到的總電子密度,你看的是密度差異。你要看的是其間的差異,就是事實上我所做的圖形,不同於我所預期的;就是假設它們是球形原子,不折不扣的球形。你如何找到-你如何繪製出這樣的圖?所以,你由這些紙張得知,所有不同點上的電子密度是多少,根據實驗-實驗上的資料是多少?現在,我想看看,假設我使原子為球形時,它們之間的差異。我該怎麼做?我必須找出這個球形看起來是什麼樣子,他們預測在所有這些不同點上的密度為何。然後要做什麼? 學生:減去。 Michael McBride教授:將它減去,對不對?所以這是密度差異。有時它被稱為變形,因為它是當形成鍵結時,電子分佈的變形程度有多少。Okay,所以你觀察到電子密度;是由X射線,根據實驗得知的;減去原子的電子密度,你算得出來;你知道球形原子是什麼樣子。我們進行下一步。要如何知道該怎麼做?但是,你怎麼知道在哪裡-當要減去它時,你必須確定你將原子放置在正確的位置上,來將它減去,對不對?你怎麼知道該將它們放在哪裡?你怎麼知道該將球形原子放在哪裡去減它呢?請說? 學生:放在環的中心。 Michael McBride教授:把它放在環的中心,對不對?Okay,我們看看像這樣的例子。這是由 Leiserowitz 與Ziva Berkovitch-Yellin 所做的-在三十三年前。這是個有趣的分子,因為它有很多不同種類的鍵:有單鍵、雙鍵-事實上是3個雙鍵排成一列,及擁有這些共振鍵的苯環。Okay,我們先來看看其中一個苯環,Okay?我展示的這張是密度差異圖;這是總電子密度,減去原子的電子密度;但注意,所減去的只是碳原子的密度,沒有減去氫原子。我們來看看這張大特寫,這是當原子形成分子時,電子密度有何改變,Okay? 因此,先看看上面那裡,有一些非常密集的等高線,就在上面中間那裡,這就是氫,沒有被減去,對不對?因此,當你減去球形碳原子時,它是最大的遺漏,Okay?那是-那個區域的總強度,相當於一個電子,正如你所預期的。現在,這個區域的密度總變形量,這裡有一個碳-碳鍵,只相當於十分之一個電子。路以士曾說過什麼?兩個電子;但它是十分之一個電子,Okay?現在我們將它橫切,在碳-碳鍵中,這個芳香環上的鍵,它比較大;為什麼比較大?因為它是部分雙鍵的共振結構,對不對?Okay,環中的鍵相當於0.2個電子,我們將它橫切,並轉個面,所以我們可以看到它的截面。它是圓形的,不令人驚訝。但我們將環中的鍵橫切並轉個面,它是橢圓形,不是圓形。鍵不是圓形,為什麼? 學生:它是π鍵。 Michael McBride教授:啊,因為它們部分是由這些 p 軌域組成,它在這個環上指進和指出,使它扭曲了,所以不是圓形。Okay,現在我們來看看這個分子中央的雙鍵,okay?先看這個。我們之前已經看過這個鍵,它相當於0.1個電子,有圓形的截面;但讓我們看看其中一個雙鍵。不是太意外,它有較多的電子變形密度,相當於0.2個電子,對不對?在中間的這個,實際上相當於0.3個電子,兩個都是雙鍵,所以也許看起來很相似。在某種意義上來說,確實如此。如果我們將第一個橫切,並轉個面,出於與之前同樣的原因,它呈橢圓形,有一個 p 軌域指進和指出這個白板。如果看下面這個,部分的鍵來自於重疊,如我們所看到的,來自於這些 p 軌域的重疊。因此,它是個上下形狀的橢圓形。下一個鍵如何?如果我們把它橫切,並轉個面,它也有橢圓形截面,但是垂直的,對嗎?你預期下一個鍵會是什麼樣子? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:它是對稱的,它看起來會像第一個鍵。但這裡有個有趣的情形;中間這個鍵的截面顯示,它的變形是由粉紅色的這個所產生,而不是由旁邊這些藍色所產生的。在兩端的鍵和中間的鍵上,一定有什麼不同的相互作用。大家是否聽得懂這個問題?你可能會認為,中間那個會是圓形或四葉形;但它不是,它在平面方向扭曲。但要理解這一點,你必須耐心等到下周,或本周晚些時候-當我們開始進入量子力學時。但請注意,它猶如碳形成彎曲的鍵,因此,中央兩端的碳鍵是上下的方向,但中間的是在平面上。鍵上有多少電子?所以在垂直軸上,我們要畫出電子的數量,還有鍵長,這與它是否是單鍵、雙鍵、或是三鍵有關。事實上,這裡有一個單鍵、雙鍵、和三鍵,它們的距離是這樣。如果你-事實上,你也可以畫出一個半的鍵,就是在苯環上的鍵。你預期這會如何?有多少電子-如果你是路以士,會說有多少電子在一個單鍵上? 學生:2個。 Michael McBride教授:2個。雙鍵呢? 學生:4個。 Michael McBride教授:4個。 學生:6個。 Michael McBride教授:6個。 學生:3個。 Michael McBride教授:3個。okay,一個半的鍵。Okay,這是你所預測的圖,如果路以士是正確的:2、4、6,Okay?現在,我們用剛剛這個分子來看,在每個鍵上有多少電子密度。我用顏色標示它,看起來相當不錯,對嗎?路以士萬歲!事實上,完成這個的人是Leiserowitz和 Berkovitch-Yellin。他們也看了一堆其他分子的結構,並將其加到相同的圖中,大都還不錯,除了標度是錯誤的;不是2、4、6,那邊的我沒畫出來;而是0.1、0.2、0.3。因此,鍵在電子分佈中,是很小的一部份,路以士在某種意義上,可說是對的。原子間有電子密度的轉移,以使它們鍵結在一起,對嗎?但遠低於電子對的密度。事實上,鍵的密度約是路以士也許會說的二十分之一,但他從未這麼說過,因為他還沒那麼天真,Okay?因此,並非相當於2個電子,而是2個電子的二十分之一,即0.1個電子,Okay?因此,鍵的密度約為路以士所預測的二十分之一。順帶一提,「路以士」這個單位,只有在這堂課所使用,Okay? 另一個例子是由Dunitz在瑞士所完成的,還有這些人-Schuyler Seiler和Schweizer;他是瑞士人,是鐘錶匠的後裔。這些人做了非常精確的工作,因為要做這些,如果你要從某樣東西減去某樣東西,並使其差異是有意義的,當這些數字幾乎是完全相同時,必須有相當精確的實驗工作,對嗎?記住,我們看了總電子密度,它看起來就像個球形。所以,如果你想讓它是有意義的,你必須相當在行。但那些人都相當優秀;這是在二十五年前完成的。因此,他們使用這種分子,它是高度對稱的,這很棒。記住,它有共振結構,因此所有環繞中心的鍵都是相同的,頂端的和底部的均相同。Okay,因此,我們只需看四分之一的分子,或為了方便起見,比四分之一多一點的分子。我將這裡放大,這是電子密度的差異,因此,這是電子在形成鍵的過程中,如何轉移的情形。Okay,這是芳香環上的碳-碳鍵,一個半的鍵;如果將它轉個面來看,它與你所預測的相較下是扭曲的,正如我們在前面實驗中所提過的。這是另一個,有同樣的情形。現在,這是一個單鍵,碳-碳單鍵,它的截面會是什麼樣子? Michael McBride教授:圓形,很好。這是一個碳-氮的三鍵,這是新的東西。它的截面會看起來像什麼?也許會像四葉形?像這樣,它看起來像這樣;是圓形的,它不是四葉形,不是鑽石形;截面是圓形的;我們將在稍後討論。那是什麼?這不是一個鍵。 學生:未共用電子對。 Michael McBride教授:這是氮上的未共用電子對。這有什麼特別的地方?我們要看什麼?我們要看的是碳-氟鍵。它看起來會像碳-碳鍵,還是碳-氮鍵?有什麼不同的地方?那裡沒有電子,那裡,對嗎?沒有任何電子將碳與氟鍵結。到底是怎麼回事?碳-氟鍵在哪?這提出了這個課程的第二個大問題。第一個問題是什麼? 學生:你如何瞭解? Michael McBride教授:你如何瞭解,對嗎?第二個問題可由這部影片剪輯來說明。 (技術調整) 千萬不要故障,我在這上面下很多工夫了,Okay,我來告訴你們它要說什麼- (笑聲) (技術調整) Michael McBride教授:Okay,我必需自己來(真糟糕)。 「抓一些賊吧,Hobson,這就是我們來這裡的目的」 「沒問題,長官」 噠啦、噠啦、噠啦、噠啦、噠啦、噠啦、噠啦、噠啦、噠啦、噠啦 「你覺得他像賊嗎?」 「跟什麼比,長官?」 「沒錯」 Okay (笑聲和掌聲) 「你覺得他像賊嗎?」「跟什麼比,長官?」「沒錯」 這就是第二個問題,跟什麼比?在任何定量,甚至很多定性的情形時,問題就是這個。這就是為什麼我們有尋找碳-氟鍵的問題。當談到共振時,我們已經看過這個問題。還記得我說過,當有共振現象時,分子是不尋常的穩定。你們該問什麼問題? 學生:跟什麼比較? Michael McBride教授:跟什麼比較,對嗎?在那個例子中,其結果為,比較觀察到的或計算出的能量。比較觀察到的或計算出的能量(真正的情形是什麼);如果它不是共振的話,你會如何預期。我們稍後將討論,如何,以及在什麼基礎上,你可能做出預期的情形。現在,我們討論電子密度的差異。我們比較些什麼? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:我們比較來自實驗的電子密度(或可用計算得知,如果我們可用量子力學計算的話)-但將實驗上的電子密度與什麼來比較?我們將它與什麼比較? (學生此起彼落發言) Michael McBride教授:如果只有原子的話,會產生什麼情形,對嗎?但,是什麼種類的原子,對嗎?我們將觀察或計算出的總電子密度,與一組未變形原子的總電子密度比較。未變形原子是指什麼?Okay,現在,先避開鮑立問題-討論這個還不是時候;我們需要減去的,不是正球形的氟原子。如果你計算氟原子上有多少電子,氟原子周圍空間的每個象限-有4個象限-每個象限中,將有一又四分之三個電子,對嗎?你將它乘以四,就會得到七個電子,這就是氟的價電子,對嗎?但那裡不可能有來自氟的一又四分之三個電子,還有一個來自碳的電子;在同一個地方有太多電子了,對嗎?所以你所用的不是一個變形的球形氟原子,而是準備形成鍵的氟原子;其中只有一個電子在將形成鍵的區域。所以,如果你減去一個球形原子,是從鍵結區域中減去太多了,對嗎?這就是為什麼你在那裡看不到任何電子密度。因此,如果你想瞭解比我所解釋的更多,上網去看看Dunitz教授對這個的解釋。我們有一些關於他的電影,其中談到了這個特殊的問題。Okay?總之,結論是,鍵結密度約為路以士所預測的二十分之一,對嗎?是下課的時候了,我們下堂課將繼續討論這些。 2008年9月15日