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18.417 2004秋季課程:計算分子生物學導論(Introduction to Computational Molecular Biology, Fall 2004)


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燈號說明

審定:無
翻譯:張祐誠(簡介並寄信)
編輯:鄔書林(簡介並寄信)


A DNA helix rendered in ASCII art.
用ASCII藝術來表現的DNA螺旋結構。(影像由Ramona Saldamando提供,並經授權使用)
A DNA helix rendered in ASCII art. (Image courtesy of Ramona Saldamando. Used with permission.)

課程重點

本課程以挑選過的課堂講稿為主。除了作業之外,還有專題。大量的閱讀資料相關資源亦為本課程之重點。

This course features selected lecture notes. In addition to assignments, a projects section is also available. The course also features an extensive list of readings and related resources.

課程描述

本課程介紹可於分子層級來瞭解細胞的基本電腦計算原理。包含了序列排比演算法、動態規劃、雜湊表、字尾樹、以及Gibbs取樣等主題。此外,本課程亦著重於計算方法如:基因與其物理位置之對映;基因體定序、重組及註解;RNA表現與二級結構;蛋白質結構與折疊;以及分子間的交互作用與動力學。

This course introduces the basic computational methods used to understand the cell on a molecular level. It covers subjects such as the sequence alignment algorithms: dynamic programming, hashing, suffix trees, and Gibbs sampling. Furthermore, it focuses on computational approaches to: genetic and physical mapping; genome sequencing, assembly, and annotation; RNA expression and secondary structure; protein structure and folding; and molecular interactions and dynamics.
師資
講師:
Ross Lippert
上課時數
教師授課:
每週2節
每節1.5小時
程度
研究所
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原文聲明

 
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