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審定：無
翻譯：楊朝順(簡介並寄信)、駱宛琳(簡介並寄信)
編輯：鄔書林(簡介並寄信)
此教學時程所列出的進度包括了講演(L#)與討論(TD#)的部分，其中的練習課程是指技術層面與相關討論(TD)的授課，此單元的詳細情形可以參考課程大綱的敘述。

The calendar lists both lecture (L#) and recitation (TD#) sessions. Recitations are referred to as the Techniques and Discussion (TD) sessions. See syllabus for a description of the modules.

課 課程單元 重要日期
單元一：細胞的大小與組成，並探討其彼此間涉及的調節機制。
Module 1: Size and Components of Cells and Implications with respect to Regulation
L1 介紹：細胞之組成；原核細胞與真核細胞。
Introduction: cell constituents, prokaryotes vs. eukaryotes
L2 介紹（續）。
Introduction (cont.)
單元二：脂肪酸合成酶（簡稱為FAS），聚酮合成酶（PKS），非核醣體之多肽生成酶（NRPS）。
Module 2: Fatty Acid Synthases (FAS), Polyketide Synthases (PKS), and Non-ribosomal Polypeptide Synthases (NRPS)
L3 脂肪酸合成酶：聚合反應，生物合成，化學，結構，並以聚酮合成酶（PKS），非核醣體之多肽生成酶（NRPS）之化學性質作為討論之範例。
Fatty Acid Synthase: polymerization, biosynthesis, players, chemistry, structure, chemistry as a paradigm for PKS and NRPS, medical interlude
L4 用以闡明脂肪酸合成酶（FAS）結構之實驗方法。
Experimental methods for elucidating FAS structure
TD1 β-酮醯基載體蛋白合成酶-I （FabB）。
Beta-ketoacyl-ACP Synthase I (FabB)
L5 以脂肪酸合成酶（FAS）之化學性質為例，介紹其他的分子機器。
Chemistry of FAS as paradigm for other molecular machines
L6 二次代謝：聚酮合成酶（PKS），非核醣體之多肽生成酶（NRPS）
Secondary metabolism: PKS, NRPS
L7 聚酮合成酶（PKS），非核醣體之多肽生成酶（NRPS）之化學性質：後轉譯修飾作用，起始，延長，裝飾，終止，可靠性。
Chemistry of PKS and NRPS: post-translational modification, initiation, elongation, decoration, termination, fidelity		 預期應繳交問題題組一。
Problem set 1 due
TD2 史密斯文獻。
Smith Paper
L8 聚酮合成酶（PKS），非核醣體之多肽生成酶（NRPS）之化學性質（續）。
Chemistry of PKS and NRPS (cont.)
L9 聚酮合成酶（PKS），非核醣體之多肽生成酶（NRPS）之化學性質（續，並以特殊例子說明之）。
Chemistry of PKS and NRPS (cont. with specific examples)		 預期應繳交問題題組二。
Problem set 2 due
L10 耶爾辛菌素（yersiniabactin）與膽固醇之生物合成。
Biosynthesis of yersiniabactin and cholesterol		 測驗一。
Exam 1
TD3 C.T. Walsh之文獻。
Walsh Paper
L11 C.T. Walsh之文獻。
Cholesterol biosynthesis
L12 膽固醇之調節與體內平衡。
Cholesterol regulation and homeostasis
L13 不溶性分子之感測。
Sensing insoluble molecules
TD4 低密度膽固醇之胞飲作用與放射性技術。
Endocytosis of LDL and Radioactivity Techniques
L14 單元二：經由不溶性分子在轉錄層次的調節作用。
Module 2: Regulation of the transcription level by insoluble metabolites and Module 3: Translation
單元三：轉譯作用。
Module 3: Translation: Loading, Initiation, Elongation, and Termination - A Machine in Action; Introduction to G-proteins: Switches or Motors
L15 轉譯（續）。
Translation (cont.)		 預定繳交問題題組三。
Problem set 3 due
L16 延伸與終止作用，與核醣核酸聚合酶。
Elongation, termination, RNA polymerase
TD5 結構。
Structure
L17 研究轉譯與核醣體之化學方法。
Chemical methods for studying translation and the ribosome
L18 研究轉譯與核醣體之化學方法（續）。
Chemical methods for studying translation and the ribosome (cont.)
L19 研究轉譯與核醣體之化學方法（續）。
Chemical methods for studying translation and the ribosome (cont.)		 預計繳交問題題組四。
Problem set 4 due
TD6 羥自由基足跡法。
Hydroxyl Radical Footprinting		 測驗二。
Exam 2
L20 異亮胺酸之轉移核糖核酸（tRNA）合成酶。
Isoleucine tRNA synthetase
TD7 膠體電泳與光親合探針。
Gel Electrophoresis; Photoaffinity Probes
L21 轉移RNA合成酶之編輯機轉；G蛋白質（原核轉譯延伸因子：EF-Tu因子/EF-G因子）。
tRNA synthase editing mechanisms; G proteins (EF-Tu/EF-G)
L22 G蛋白質：啟動者。
G proteins: motors
TD8 Rodnina之文獻。
Rodnina Paper
L23 G蛋白質：開關。
G proteins: switches
L24 肽鍵之形成；使用核糖體之新技術。
Peptide bond formation; new technologies using the ribosome		 預計繳交問題題組五。
Problem set 5 due
L25 單元三：併入非自然胺基酸之方法。與
單元四：當蛋白質離開核醣體時，發生了什麼事情？
Module 3: methods for the incorporation of unnatural amino acids and Module 4: what happens as a protein exits the ribosome?		 測驗三。
Exam 3
單元四：隱窩與腔室：在蛋白質摺疊與降解中所牽涉到之巨分子機器。
Module 4: Crypts and Chambers: Macromolecular Machines involved in Protein Folding and Degradation
TD9 螢光離子流影像（FRET），與穩定狀態。
FRET, Steady State
L26 有機體外（試管內）之蛋白質摺疊。
Protein folding in vitro
TD10 測驗三之解答與討論。
Exam 3 Answers and Discussion
L27 蛋白質摺疊：有機體外（試管內）與體內；降解。
Protein folding: in vitro vs. in vivo; degradation
L28 有機體內之蛋白質摺疊。
Protein folding in vivo
L29 陪伴蛋白。
Chaperone proteins
TD11 GroEl蛋白/ GroES蛋白。
GroEl / GroES
L30 GroEl蛋白/ GroES蛋白。
GroEL/GroES
L31 蛋白酶。
Proteases		 預定繳交問題題組六。
Problem set 6 due
L32 蛋白酶體。
Proteosome		 測驗四。
Exam 4
TD12 DnaJ蛋白之專一性。
DnaJ specificity
L33 蛋白酶體（續）。
Proteosome (cont.)
L34 泛素在降解之角色。
Role of Ubiquitin in degradation
L35 透過多聚泛素化之降解作用。
Degradation through polyubiquitination
期末考（三小時，前三十分鐘的考試範圍從上次考試後的範圍開始，後一個半小時的範圍將包含整學期之授課內容。）
Final Exam (3 hours. The first 30 minutes will cover the information since the last exam. The remaining two and a half hours will cover the entire semester.)

 
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