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Table for Lecture Notes
第一部分：系统微生物学－将细胞视成一个完全搅拌反应器
Part I: Systems Microbiology - 'The Cell as a Well-stirred Bioreactor' |
| 1 |
简介 (PDF)
Introduction (PDF)
Michaelis-Menten Kinetics |
| 2 |
平衡结合
Equilibrium Binding
合作现象
Cooperativity |
| 3 |
嗜菌体(PDF)
Lambda Phage (PDF)
多稳定性
Multistability
相关MATLAB® 档案(M)
Associated MATLAB® Code File (M) |
| 4 |
多稳定性（继续上次课程）(PDF)
Multistability (cont.) (PDF) |
| 5 |
合成基因开关
Synthetic Genetic Switches |
| 6 |
稳定性分析(PDF)
Stability Analysis (PDF) |
| 7 |
大肠杆菌的趋化性介绍(PDF - 1.3 MB)
Introduction E. coli Chemotaxis (PDF - 1.3 MB) |
| 8 |
格式化和稳健形趋化性模型的比较(PDF)
Fine-tuned versus Robust Chemotaxis Models (PDF)
相关MATLAB® 档案(M)
Associated MATLAB® Code File (M) |
| 9 |
掩饰趋化性(PDF)
Wrapping up Chemotaxis (PDF) |
| 10 |
基因震荡器(PDF)
Genetic Oscillators (PDF)
相关MATLAB® 档案(M)
Associated MATLAB® Code File (M) |
| 11 |
基因震荡器（继续上次课程）
Genetic Oscillators (cont.) |
| 12 |
随机化学动力学
Stochastic Chemical Kinetics |
| 13 |
随机化学动力学（继续上次课程）
Stochastic Chemical Kinetics (cont.) |
第二部分：细胞系统生物学－将细胞视成一个既有浓度梯度的分隔系统
Part II: Cell Systems Biology - 'The Importance of Diffusion and Gradients for Cellular Regulation' |
| 14 |
细胞系统生物学简介(PDF)
Introduction Cell Systems Biology (PDF)
Fick法则
Fick's Laws |
| 15 |
局部刺激
Local Excitation
整体抑制理论
Global Inhibition Theory |
| 16 |
局部刺激（继续上次课程）(PDF)
Local Excitation (cont.) (PDF)
整体抑制理论（继续上次课程）
Global Inhibition Theory (cont.) |
| 17 |
大肠杆菌中快速极间震荡(PDF)
Rapid Pole-to-pole Oscillations in E. coli (PDF)
相关MATLAB® 档案(1 - 1 ) (1- 2 )
Associated MATLAB® Code File (M - 1 of 2) (M - 2 of 2)
|
| 18 |
大肠杆菌中快速极间震荡（继续上次课程）(PDF)
Rapid Pole-to-pole Oscillations in E. coli (cont.) (PDF) |
| 19 |
真核生物的梯度感应模型
Models for Eukaryotic Gradient Sensing |
| 20 |
真核生物的梯度感应模型（继续上次课程） (PDF)
Models for Eukaryotic Gradient Sensing (cont.) (PDF) |
| 21 |
细胞骨架动力学建模
Modeling Cytoskeleton Dynamics |
| 22 |
细胞骨架动力学建模（继续上次课程）
Modeling Cytoskeleton Dynamics (cont.) |
第三部分：发育系统生物学－由单一细胞建构一个生物体
Part III: Developmental Systems Biology - 'Building an Organism Starting From a Single Cell' |
| 23 |
数量感应(PDF)
Quorum Sensing (PDF) |
| 24 |
期末习题集咨询时间
Final Problem Set Question Hour |
| 25 |
果蝇发育学(PDF)
Drosophila Development (PDF) |
