第一部分：系统微生物学－将细胞视成一个完全搅拌反应器
Part I: Systems Microbiology - 'The Cell as a Well-stirred Bioreactor' |
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简介
Introduction
酵素动力学
Michaelis-Menten Kinetics |
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平衡结合
Equilibrium Binding
合作现象
Cooperativity |
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嗜菌体
Lambda Phage
多稳定性
Multistability |
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多稳定性（继续上次课程）
Multistability (cont.) |
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合成基因开关
Synthetic Genetic Switches |
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稳定性分析
Stability Analysis |
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大肠杆菌的趋化性介绍
Introduction E. coli Chemotaxis |
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格式化和稳健形趋化性模型的比较
Fine-tuned versus Robust Chemotaxis Models |
缴交第一次的习题集
Problem set 1 due |
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掩饰趋化性
Wrapping up Chemotaxis |
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基因震荡器
Genetic Oscillators |
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基因震荡器（继续上次课程）
Genetic Oscillators (cont.) |
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随机化学动力
Stochastic Chemical Kinetics |
缴交第二次的习题集
Problem set 2 due |
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随机化学动力学（继续上次课程）
Stochastic Chemical Kinetics (cont.) |
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第二部分：细胞系统生物学－将细胞视成一个既有浓度梯度的分隔系统
Part II: Cell Systems Biology - 'The Importance of Diffusion and Gradients for Cellular Regulation' |
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细胞系统生物学简介
Introduction Cell Systems Biology
Fick法则
Fick's Laws |
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局部刺激
Local Excitation
整体抑制理论
Global Inhibition Theory |
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局部刺激（继续上次课程）
Local Excitation (cont.)
整体抑制理论（继续上次课程）
Global Inhibition Theory (cont.) |
缴交第三次的习题集
Problem set 3 due |
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大肠杆菌中快速极间震荡
Rapid Pole-to-pole Oscillations in E. coli |
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大肠杆菌中快速极间震荡（继续上次课程）
Rapid Pole-to-pole Oscillations in E. coli (cont.) |
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真核生物的梯度感应模型
Models for Eukaryotic Gradient Sensing |
缴交第四次的习题集
Problem set 4 due |
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真核生物的梯度感应模型（继续上次课程）
Models for Eukaryotic Gradient Sensing (cont.) |
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细胞骨架动力学建模
Modeling Cytoskeleton Dynamics |
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细胞骨架动力学建模（继续上次课程）
Modeling Cytoskeleton Dynamics (cont.) |
缴交第五次的习题集
Problem set 5 due |
第三部分：发育系统生物学-由单一细胞建构一个生物体
Part III: Developmental Systems Biology - 'Building an Organism Starting From a Single Cell' |
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数量感应
Quorum Sensing |
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期末习题集咨询时间
Final Problem Set Question Hour |
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果蝇发育学
Drosophila Development |
期末习题集缴交时间
Take home final due |
