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18.417 2004秋季课程:计算分子生物学导论(Introduction to Computational Molecular Biology, Fall 2004)


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审定:无
翻译:张佑诚(简介并寄信)
编辑:邬书林(简介并寄信)


A DNA helix rendered in ASCII art.
用ASCII艺术来表现的DNA螺旋结构。(影像由Ramona Saldamando提供,并经授权使用)
A DNA helix rendered in ASCII art. (Image courtesy of Ramona Saldamando. Used with permission.)

课程重点

本课程以挑选过的课堂讲稿为主。除了作业之外,还有专题。大量的阅读资料相关资源亦为本课程之重点。

This course features selected lecture notes. In addition to assignments, a projects section is also available. The course also features an extensive list of readings and related resources.

课程描述

本课程介绍可于分子层级来了解细胞的基本计算机计算原理。包含了序列排比算法、动态规划、杂凑表、字尾树、以及Gibbs取样等主题。此外,本课程亦着重于计算方法如:基因与其物理位置之对映;基因体定序、重组及注解;RNA表现与二级结构;蛋白质结构与折叠;以及分子间的交互作用与动力学。

This course introduces the basic computational methods used to understand the cell on a molecular level. It covers subjects such as the sequence alignment algorithms: dynamic programming, hashing, suffix trees, and Gibbs sampling. Furthermore, it focuses on computational approaches to: genetic and physical mapping; genome sequencing, assembly, and annotation; RNA expression and secondary structure; protein structure and folding; and molecular interactions and dynamics.
师资
讲师:
Ross Lippert
上课时数
教师授课:
每周2节
每节1.5小时
程度
研究所
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原文声明

 
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